Mikrobiyota, genel olarak çok hücreli canlıların çeşitli organlarında yaşayan simbiyotik ve patojenik mikroorganizmaların ekolojik topluluklarına verilen addır.
Son yıllarda, moleküler genetik alanındaki ilerlemeler ile birlikte, farklı organ, doku ve çevredeki mikrobiyal çeşitliğe dair çalışmalar hız kazanmıştır. Mikrobiyota çalışması ile birlikte, izolasyona uğrayan materyalde bulunan bütün bakteriler tür ve alt türe kadar tanımlanabilmektedir.
Krosgen Biyoteknoloji alt yapısında bulunan NGS cihazı ile yapılan mikrobiyota çalışması ile;
- Bakteri türü sınırlaması olmadan tüm bakteri türlerini tanılayabildiği için, emsal yöntemlere göre çok daha hızlı ve düşük maliyetlidir.
- Besi yerinde çoğalması zor veya imkansız olan mikroorganizmaların taraması yapılabilmektedir.
- Çalışma sonucunda bulunan bakterilerin türleri belirlendiği gibi ayrıca birbirlerine göre oranları analiz edilebilmektedir.
- Krosgen Biyoteknoloji olarak mikrobiyota çalışmalarınız için gerekli olan sarf malzemeyi sizin için temin etmekte ve gerekli olan laboratuvar çalışmalarını kendi laboratuvarında gerçekleştirmektedir.
Mikrobiyota Aşamaları
- Örneğin Toplaması
Örnekte var olan bakterilerin doğal ortamında ayrıldıktan sonra değişmemesi için, örnek “Collection Tube” içine alınır. - Örnekten Bakteri DNA’sı İzolasyonu
Her örneğin bakteri izolasyonu gerçekleştirilir. - Kütüphane Oluşturulması
NGS sistemine toplu örnek yüklenmesi için her örneğe moleküler barkodlama yapılır - Sekans İşlemi
PCR cihazında çoğaltılan her bir bölge 150×2 bp olacak şekilde 50 tekrarlı okunur. - Biyoinformatik Analiz
Çıkan sonuçlar, veritabanlarında var olan bakteri DNA dizileri ile eşleştirilerek, örnek içinde bulunan bakteriler tanılanır.
